旋转和角度
circos中对方向的定义是:
你可以通过:
来修改角度,修改角度让1号染色体从你设置的位置开始
顺逆时针
定义方式
<image>
angle_orientation = counterclockwise
...
</image>
如果你的image板块是以文件的形式加入的,请用 * 来修改:
<image>
<<include etc/image.conf>>
angle_orientation* = counterclockwise
...
</image>
ideogram的方向改变
如果我只想改变某一条染色体的方向的话,请用一下语句
chromosomes_reverse = hs1,hs2,...
你为什么要反转单个ideogram? 如果您使用link的话,则可以通过调整ideogram方向来控制色带是否扭曲。 或者,如果您仅显示两个ideogram(例如,样本和参考),则分别以彼此接近的开始和结束点分别显示表意文字可能会更有意义。
chromosomes = hs1;hs2
chromosomes_reverse = hs2