染色体顺序

1、默认顺序

默认顺序是由karyotype defination file 决定的。我们之前在选择特定的染色体的时候有一定的定义顺序如:

chromosomes = hs1;hs2;hs3;hs4;hs5;hs6;hs7;hs8

但是这个顺序并不会改变我们画出来的顺序。

2、改变顺序:

2.1 明确指定的方式:

chromosomes_order = hs2,hs3,hs1,hs5,hs4,hs8,hs7,hs6

需要注意的是选择染色体时使用的是分号,而设置顺序的时候用的是逗号

2.2 部分顺序调整

chromosomes_order = hs5,hs4

那么将只改变5和4号染色体的相对位置,其他不变:1 2 3 6 5 4 7 8

2.3 锚定

有的时候你需要将指定染色体放在最开始或末尾,这时可以用:

chromosomes_order = ^,hs5 #5号放在开头,顺序为5 1 2 3 4 6 7 8

chromosomes_order = hs5,$ #5号放在末尾 1 2 3 4 6 7 8 5

更多定义方法请见here

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