为标签设置边缘

有的时候刻度太密集会导致标签也过于密集,不便于查看。本节将会提出方法解决该类问题。

最小间距设置:

ticks:

<ticks>
  # define minimum separation for all ticks
  tick_separation = 3p
  ...

  <tick>
  # define minimum separation for a specific tick group
  tick_separation = 2p
    ...
  </tick>

  ...

</ticks>

  • 这个最小separation应该始终保持在2、3像素,以保证在图像缩小时刻度不会重叠。
  • tick的标签大小不会影响tick间距的计算
  • tick间距按照group-to-group的顺序进行。板块之间互相不影响

ideogram边缘的tick设置

一般在染色体分离的边缘你可能并不希望再画上tick,此时你可以关闭它们的出现:

<ticks>
min_distance_to_edge = 10p
...
<tick>
min_distance_to_edge = 5p
...
</tick>
...
</ticks>

官方conf文件here

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